Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HLA-CQ95604 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HLA-CQ95604 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms