Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CELF1Q92879 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CELF1Q92879 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms