Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG3Q6UXM1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms