Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FAM78BQ5VT40 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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