Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ERCC6L2Q5T890 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC6L2Q5T890 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC6L2Q5T890 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ERCC6L2Q5T890 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms