Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CA9Q16790 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CA9Q16790 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CA9Q16790 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CA9Q16790 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CA9Q16790 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CA9Q16790 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CA9Q16790 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CA9Q16790 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CA9Q16790 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CA9Q16790 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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CA9Q16790 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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CA9Q16790 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CA9Q16790 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CA9Q16790 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CA9Q16790 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CA9Q16790 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CA9Q16790 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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CA9Q16790 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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CA9Q16790 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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CA9Q16790 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CA9Q16790 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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CA9Q16790 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CA9Q16790 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CA9Q16790 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CA9Q16790 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CA9Q16790 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CA9Q16790 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CA9Q16790 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CA9Q16790 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CA9Q16790 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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