Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FSCN1Q16658 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms