Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP7Q16576 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBBP7Q16576 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms