Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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UBE3CQ15386 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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UBE3CQ15386 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
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UBE3CQ15386 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE3CQ15386 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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