Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ATRQ13535 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ATRQ13535 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATRQ13535 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATRQ13535 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATRQ13535 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
ATRQ13535 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ATRQ13535 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
ATRQ13535 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ATRQ13535 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ATRQ13535 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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