Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1R1AQ13522 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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