Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MKRN3Q13064 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MKRN3Q13064 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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MKRN3Q13064 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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MKRN3Q13064 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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MKRN3Q13064 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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MKRN3Q13064 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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MKRN3Q13064 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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MKRN3Q13064 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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MKRN3Q13064 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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MKRN3Q13064 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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MKRN3Q13064 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKRN3Q13064 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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