Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRB1P82279 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRB1P82279 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB1P82279 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB1P82279 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB1P82279 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB1P82279 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB1P82279 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB1P82279 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB1P82279 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB1P82279 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB1P82279 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB1P82279 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB1P82279 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB1P82279 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CRB1P82279 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRB1P82279 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRB1P82279 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRB1P82279 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CRB1P82279 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRB1P82279 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRB1P82279 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms