Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRX3P78415 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRX3P78415 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRX3P78415 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IRX3P78415 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms