Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
AP3M2P53677 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
AP3M2P53677 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms