Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIP4K2AP48426 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIP4K2AP48426 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms