Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATRXP46100 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRXP46100 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRXP46100 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRXP46100 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRXP46100 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRXP46100 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRXP46100 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRXP46100 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRXP46100 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRXP46100 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRXP46100 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRXP46100 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRXP46100 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATRXP46100 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATRXP46100 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATRXP46100 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATRXP46100 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms