Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC1P33527 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC1P33527 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms