Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
OTX2P32243 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
OTX2P32243 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms