Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GJB2P29033 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GJB2P29033 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GJB2P29033 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GJB2P29033 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms