Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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HOXD10P28358 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXD10P28358 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
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HOXD10P28358 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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