Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms