Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEURL1BA8MQ27 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEURL1BA8MQ27 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms