Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD2APQ9Y5K6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD2APQ9Y5K6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD2APQ9Y5K6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD2APQ9Y5K6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD2APQ9Y5K6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD2APQ9Y5K6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD2APQ9Y5K6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD2APQ9Y5K6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD2APQ9Y5K6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD2APQ9Y5K6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD2APQ9Y5K6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD2APQ9Y5K6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms