Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TREX1Q9NSU2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TREX1Q9NSU2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms