Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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BPESC1Q9GZL8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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BPESC1Q9GZL8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BPESC1Q9GZL8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BPESC1Q9GZL8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BPESC1Q9GZL8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BPESC1Q9GZL8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BPESC1Q9GZL8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BPESC1Q9GZL8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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