Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2U0

Psg23, MCG140255, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psg23Q9D2U0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Psg23Q9D2U0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Psg23Q9D2U0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Psg23Q9D2U0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Psg23Q9D2U0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Psg23Q9D2U0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms