Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BPIFA3Q9BQP9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms