Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SGIP1Q9BQI5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGIP1Q9BQI5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms