Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDK5RAP2Q96SN8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK5RAP2Q96SN8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms