Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB3IPQ96QF0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB3IPQ96QF0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms