Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 IL12A-AS1-201ENST00000462431 988 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 LINC02147-202ENST00000509669 637 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 AC007228.2-201ENST00000602145 1328 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 ACP1-203ENST00000405233 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A3Q96HJ5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms