Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TIMD4Q96H15 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms