Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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RABGGTAQ92696 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RABGGTAQ92696 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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