Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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DTX3Q8N9I9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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DTX3Q8N9I9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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DTX3Q8N9I9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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DTX3Q8N9I9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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DTX3Q8N9I9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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DTX3Q8N9I9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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DTX3Q8N9I9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX3Q8N9I9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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