Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms