Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
YTHDF3Q7Z739 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
YTHDF3Q7Z739 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms