Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms