Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ISXQ2M1V0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms