Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TTF1Q15361 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TTF1Q15361 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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