Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDGFRLQ15198 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms