Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DUSP4Q13115 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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