Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DCDC1P59894 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DCDC1P59894 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms