Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BCAMP50895 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BCAMP50895 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCAMP50895 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCAMP50895 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BCAMP50895 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BCAMP50895 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BCAMP50895 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms