Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP6P35125 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP6P35125 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP6P35125 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP6P35125 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP6P35125 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP6P35125 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP6P35125 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP6P35125 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP6P35125 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP6P35125 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP6P35125 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP6P35125 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP6P35125 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP6P35125 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP6P35125 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP6P35125 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP6P35125 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP6P35125 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP6P35125 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP6P35125 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP6P35125 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP6P35125 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP6P35125 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP6P35125 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP6P35125 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP6P35125 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP6P35125 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP6P35125 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP6P35125 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP6P35125 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP6P35125 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP6P35125 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP6P35125 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP6P35125 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP6P35125 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP6P35125 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP6P35125 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP6P35125 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP6P35125 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP6P35125 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP6P35125 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP6P35125 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP6P35125 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP6P35125 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP6P35125 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP6P35125 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP6P35125 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP6P35125 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP6P35125 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP6P35125 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP6P35125 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP6P35125 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP6P35125 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP6P35125 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP6P35125 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP6P35125 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP6P35125 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP6P35125 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP6P35125 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms