Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DNMT1P26358 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms