Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRKACBP22694 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRKACBP22694 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms