Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD8P13378 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD8P13378 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms