Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL6A2P12110 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms