Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFT2D2O95562 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms